میکروبیوم روده افراد باهم یکسان نبوده و تفاوت دارند، بنابر‌این مکمل‌های پروبیوتیکی ممکن است سلامت روده افراد را به‌طور یکسان تقویت نکنند. میکروبیوتای روده از بدو تولد با انسان است و بر عملکرد بدن تأثیر می‌گذارد. میکروبیوتای انسانی از باکتری‌ها، ویروس‌ها، قارچ‌ها و سایر حیوانات تک‌سلولی تشکیل شده است که در بدن زندگی می‌کنند.
محققان دانشگاه کلرادو، اثر روزه متناوب و محدودیت کالری روزانه را بر کاهش وزن مقایسه کردند و نتیجه گرفتند که هر دو منجر به تنوع میکروبیوم شدند. یکی از آن‌ها تنوع آلفا (تنوع گونه‌های میکروبی در هر فرد) نام دارد. هر‌‌چه میکروبیوم تنوع و قدرت بیش‌تری داشته باشد، سلامت و لاغری بهتری را در‌پی دارد، چون میکروب‌های بیش‌تری در بدن وجود دارد که به معیارهای سلامتی ما واکنش نشان می‌دهند.
طبق این تحقیق، در هر دو رژیم غذایی، تنوع آلفا به یک شکل بود؛ یعنی هر دو استراتژی کاهش وزن از نظر تنوع میکروبیوم به یک اندازه موفق هستند. در نتیجه برای کاهش وزن، هر کدام که برای ما مفید‌تر است را انتخاب می‌کنیم که در هر دوی آن‌ها میکروبیوم بدن ما تغییر کرده و تنوع آن افزایش می‌یابد.
طبق گفته محققان، بین میکروبیوم روده و متیلاسیون DNA روابطی وجود دارد. متیلاسیون یک پدیده اپی‌ژنتیکی است که گروه‌های متیل از سیتوزین، کم یا اضافه می‌شوند، یعنی بدون تغییر مستقیم در توالی DNA، ژن‌ها را تنظیم یا فشرده می‌کند؛ مثلا افزایش متیلاسیون در مناطق تنظیم‌کننده ژن، منجر به سرکوب بیان آن ژن می‌شود.
در نتیجه، عوامل اپی‌ژنتیکی مانند متیلاسیون، روی ژن‌ها و سلامتی ما تاثیر می‌گذارند. هر فرد ژن‌هایی دارد که اگر فعال شوند ممکن است به نوعی بیماری مبتلا شود، اما اگر سبک زندگی او سالم باشد، احتمالا این ژن‌ها فعال نشوند. حتی افزایش و تغییر ترکیبات میکروب‌های روده که حاصل رژیم‌های غذایی هستند بر سطح متیلاسیون DNA و عملکرد های بدن اثر می‌گذارند!
